Ученые из Университета Буффало, которые проводят геномное секвенирование вируса SARS-CoV2 в округе Эри, наблюдают рост случаев омикрона, что свидетельствует о том, что регион демонстрирует траекторию, аналогичную национальным тенденциям.
И несмотря на сообщения о быстром скачке омикрона в других странах, ученые UB отмечают, что есть причины, по которым здесь может быть не так, пишет medicalxpress.com.
Основываясь на партии из 344 образцов, взятых до 21 декабря, исследователи сообщают, что уровень омикрона в регионе в то время составлял примерно 18 процентов. Омикрон был обнаружен в деидентифицированных образцах, предоставленных KSL Diagnostics, Catholic Health и Kaleida.
«Это было почти на одном уровне со средним показателем по стране в 22 процента омикронов за тот период», - сказала Дженнифер Сёртиз, доктор философии, доцент биохимии Школы медицины и биомедицинских наук Джейкобса в UB, которая возглавляет усилия по секвенированию. «Важно отметить, что данные секвенирования не являются данными в реальном времени и что фактические уровни омикрона, вероятно, значительно выше».
По данным Центров по контролю и профилактике заболеваний, по состоянию на 25 декабря на долю omicron в США приходилось около 58,5% вариантов, и этот показатель продолжает расти.
«Наши ученые продолжают отслеживать заболеваемость COVID-19 в нашем сообществе, предоставляя важную информацию в области общественного здравоохранения как официальным лицам, так и поставщикам медицинских услуг», - сказала Эллисон Брашир, доктор медицинских наук, вице-президент UB по наукам о здоровье и декан школы Джейкобса.
«Мы знаем, что вариант omicron COVID-19 более передается, чем другие варианты, и весьма вероятно, что этот вариант ответственен за недавнее существенное и резкое увеличение случаев COVID-19 в округе Эри», - сказал комиссар здравоохранения округа Эри. Бурштейн, доктор медицины, также клинический профессор педиатрии в школе Джейкобса.
Вероятны более высокие госпитализации
Сёртиз отметил, что при таком большом количестве омикронов в Западном Нью-Йорке вполне вероятно, что это количество, скорее всего, приведет к увеличению количества госпитализаций, даже если многие люди не страдают тяжелыми заболеваниями.«При таком большом количестве диагностированных случаев COVID-19 больницы перегружены, отчасти из-за нехватки коек, но, что более важно, потому, что персонал заражается и заболевает», - сказала она. «По мере того, как мы продвигаемся дальше в эту волну, количество госпитализаций будет продолжать расти из-за огромного числа инфицированных».
Сёртиз указал на ключевое различие между США и Южной Африкой, где наблюдается быстрый пик и более низкая вирулентность.
«Население в Южной Африке просто моложе, чем в США, и мы знаем, что молодые люди с меньшей вероятностью серьезно заболеют инфекцией SARS-CoV-2, хотя некоторые определенно заболеют», - сказала она.
По этим причинам официальные лица здравоохранения еще раз призывают людей сделать все возможное, чтобы ограничить распространение.
«Мы просим людей продолжать делать выбор, который защищает ваше здоровье и здоровье окружающих», - сказал Бурштейн. Сделайте вакцинацию и усиленную вакцинацию, носите маски, плотно прилегающие к лицу, практикуйте социальное дистанцирование и оставайтесь дома и подальше от других, когда болеете. И, пожалуйста, если в вашей жизни есть люди, которые более уязвимы к COVID-19 из-за их возраст, иммунодефицитные состояния или прививочный статус тоже делают правильный выбор для их защиты ».
Сёртиз подчеркнул важность так называемой модели предотвращения инфекции «Швейцарский сыр», которая сочетает в себе все эти подходы: «Сделайте вакцинацию. Носите хорошие маски - одних тканевых масок уже недостаточно. Избегайте больших скоплений людей, особенно в помещении, когда маски не подходят. использоваться постоянно. Регулярно проходить тестирование. И осознавать, что экспресс-анализ на антигены несовершенен и может привести к ложноотрицательным результатам.
«Комбинированный подход к предотвращению инфекции - лучший вариант, который значительно снизит ваш риск», - сказала она.
Том Руссо, доктор медицины, руководитель отделения инфекционных заболеваний в школе Джейкобса, согласен. «Поведение является критическим фактором, влияющим на вероятность заражения. Пожалуйста, избегайте ситуаций в помещении при общении с людьми за пределами вашего дома, где маски нельзя использовать постоянно. Обычно это происходит, когда речь идет о еде / питье. Хотя существует риск заражения меньше на открытом воздухе, это все еще может произойти, когда люди находятся близко друг к другу в течение длительного периода времени. Пожалуйста, будьте осторожны и будьте благоразумны ».
Растут опасения по поводу того, что вырисовывается в ближайшие несколько недель, на основании повышенной проницаемости омикрона и свидетельств того, что заболеваемость этим вариантом продолжает расти.
Повышенная заболеваемость
Сёртиз объяснил, что доказательства увеличения заболеваемости омикроном частично основаны на наличии так называемого «выпадения» гена S.«Определенные типы тестов ПЦР усиливают три разных гена из генома SARS-CoV-2 для проверки на вирус», - сказала она.
Одним из таких генов является ген S, кодирующий белок-шип. Она объяснила, что когда в гене спайка есть небольшие делеции, как в случае с омикроном, короткие нуклеиновые кислоты, называемые праймерами, которые используются для амплификации генов, не могут распознать ген S, поэтому он не амплифицируется.
«Другими словами, он даст положительный результат на два других гена в тесте, но не будет амплификации гена S», - сказал Сёртиз.
«Таким образом, выпадение S-гена является полезным показателем омикрона, - сказала она, - и позволяет нам предсказать уровень омикрона на основе определенных тестов ПЦР, что ближе к реальному времени, чем секвенирование, которое в настоящее время занимает около недели».
Не все центры тестирования используют тесты, выявляющие ген S, но компания KSL Diagnostics, партнер по тестированию UB, делает это. С мая 2020 года KSL Diagnostics проводит от 15 до 20 процентов ПЦР-тестов на COVID-19 в Западном Нью-Йорке.
«В первые две недели декабря мы наблюдали лишь несколько случаев выбывания S, что составило менее 5 процентов положительных образцов», - сказал Лакшманан Суреш, доктор философии, основатель и управляющий партнер KSL Diagnostics Inc.
«С третьей недели декабря число отсеявшихся S начало резко увеличиваться, и на сегодняшний день более 95 процентов положительных образцов в нашей лаборатории относятся к этому типу», - продолжил он. «Основываясь на том, что я вижу в нашей лаборатории, я бы сказал, что преобладающим вариантом, циркулирующим в нашем сообществе, является вариант омикрона».
Не приравнивайте омикрон к простуде
Симптомы варианта омикрона включают боль в горле, заложенность носа, усталость, головную боль, лихорадку и потерю способности ощущать вкус или запах; Короче говоря, они могут имитировать вирус любого респираторного вируса, но Руссо предупредил: «Не приравнивайте омикрон к простуде. Хотя ранние данные предполагают, что омикрон может быть менее вирулентным, чем более ранние варианты, это все же потенциально смертельный вирус. И даже в этом случае - так называемые «легкие» инфекции могут быть довольно неприятными ».Он добавил, что к тем, кто подвержен наибольшему риску развития тяжелого заболевания или неблагоприятного исхода от омикрона , относятся непривитые, люди с ослабленным иммунитетом, беременные женщины, пожилые люди и люди с серьезным основным заболеванием, особенно если не усилена.
Руссо отметил, что людей, как правило, беспокоят в первую очередь непосредственные последствия COVID-19 (легкое заболевание в сравнении с госпитализацией и смертью). «Однако очевидно, что« продолжительный COVID »может быть очень проблематичным в повседневной жизни», - сказал он. «Возможные долгосрочные последствия инфекции COVID-19, которые могут не проявляться клинически в течение многих лет или десятилетий, вызывают серьезную озабоченность. Поэтому ваша лучшая стратегия - не заразиться».
