Исследователи из Университета Иллинойса в Чикаго разработали высококачественный тест, который можно использовать в домашних тестах для быстрого скрининга COVID-19. Результаты раннего доклинического исследования показывают, что тесты с новым анализом могут быть столь же надежными, как и лабораторные молекулярные тесты, называемые ПЦР-тестами, которые используются в больницах для клинической диагностики, пишет medicalxpress.com.
«Наличие быстрых и простых в использовании тестов на COVID-19 имеет решающее значение, особенно в сообществах с низким уровнем вакцинации и низким доступом к услугам здравоохранения, включая эпиднадзор за COVID-19 и диагностическое тестирование», - сказал Сяовей Ван, UIC профессор фармакологии и биоинженерии. «Текущий кризис создал беспрецедентную потребность в быстрых тестах, которые очень чувствительны, и чем раньше мы сможем разработать более совершенные технологии и варианты тестирования, тем лучше будет для всех».
Реагенты для анализа вызывают химическую реакцию при смешивании с биологическим образцом, содержащим вирус или другой маркер. Например, домашний тест на беременность состоит из реагентов, которые реагируют на гормоны беременности в образце мочи.
В лабораторных молекулярных тестах ученые смешивают образцы с аналитическими реагентами в строго контролируемом процессе. Поскольку условия реакции (например, температура) строго контролируются, тесты являются как чувствительными, так и избирательными, а это означает, что вероятность ложноположительных или ложноотрицательных результатов очень мала. Однако эти лабораторные тесты могут быть дорогими и доступны не во всех общинах и полевых условиях.
Проблема с домашними и полевыми тестами заключается в том, что им нужны реактивы для анализа, чтобы они работали в менее контролируемых условиях, что увеличивает вероятность получения ложных результатов или неубедительных тестов. Один метод, называемый петлевой изотермической амплификацией (LAMP), который использует шесть праймеров ДНК для обнаружения патогенов, показал себя многообещающим для других патогенов, таких как малярия, но не был эффективно применен к COVID-19.
Ван и исследователи UIC, разработавшие новый анализ COVID-19, впервые создали и применили алгоритм биоинформатики для определения наилучших потенциальных комбинаций праймеров ДНК для надежного обнаружения SARS-CoV-2, вируса, вызывающего COVID-19, с помощью метода LAMP. Затем исследователи провели серию симуляций, чтобы оптимизировать условия, в которых потенциальные комбинации праймеров ДНК работают лучше всего в полевых условиях.
После использования своего анализа для разработки метода тестирования с использованием праймеров и условий ДНК, команда разработала эксперименты, чтобы увидеть, как проходит тест.
В экспериментах Ван и его сотрудники обрабатывали искусственные образцы и образцы людей с помощью стандартного теста ПЦР и своего нового теста. Когда результаты были сопоставлены, исследователи не только увидели значительное улучшение эффективности своего теста по сравнению с другими, использующими метод LAMP для обнаружения вируса, но также и то, что он был сопоставим с более дорогими тестами ПЦР золотого стандарта.
В своей статье «Разработка тестов RT-LAMP для быстрой диагностики SARS-CoV-2 в слюне», опубликованной в журнале EBioMedicine , исследователи сообщают, что новые тесты LAMP были так же эффективны, как и стандартные тесты ПЦР в SARS-CoV-2. обнаружения и что их новые анализы обладают уникальными преимуществами, такими как скорость и прямое обнаружение вирусной РНК в слюне, что делает тест «идеальным для недорогой диагностики в месте оказания медицинской помощи».
Ван сказал, что это лабораторное исследование показывает, что их тест работает, но им необходимо будет подтвердить его в дальнейших исследованиях с большим количеством образцов от реальных пациентов. Он надеется, что к лету они проведут исследование, включающее около 1500 образцов пациентов. Если исследование подтвердит тест , данные будут отправлены вместе с заявлением в Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США для получения разрешения на использование в экстренных случаях.
