Многие лаборатории по всему миру оценивают положение Омикрона в отношении его трансмиссивности, вирулентности, серьезности заболевания, которое он может вызвать, и его способности уклоняться от защиты, индуцированной вакциной.
[caption id="attachment_256653" align="aligncenter" width="960"]
Вариант Омикрон подтвержден на всех континентах, кроме Антарктиды. Фото: Pixabay[/caption]
Омикрон, первый вариант COVID-19, который Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) за несколько дней повысила до вызывающего обеспокоенность варианта (VOC), 8 ноября на радаре лаборатории Lancet в Южной Африке, хотя предполагается, что он циркулировал раньше, пишет medicalxpress.com.
Благодаря своей превосходной системе геномного надзора органы здравоохранения Южной Африки очень быстро сообщили о случаях этого варианта. В отличие от других вариантов, Omicron можно обнаружить с помощью надежного ПЦР-теста без необходимости секвенирования всего генома, что позволило быстро отслеживать его распространение.
К 23 ноября в провинции Гаутенг в Южной Африке было выявлено 1100 случаев этого варианта (73 процента от всех положительных случаев) по сравнению с 10, зарегистрированными в начале ноября. По состоянию на 3 декабря Omicron официально превзошел вариант Delta в Южной Африке.
Эффективное воспроизведение число (число людей, инфицированных одним инфицированным человеком) для Omicron оценивается выше шести, в то время как эффективное число воспроизведения для Delta была оценена около пяти, а число воспроизведения для очень заразной болезни, как ветряная оспа является девять.
Где распространился Омикрон?
Вариант Омикрон подтвержден на всех континентах, кроме Антарктиды. Зарегистрированные случаи за пределами Южной Африки, похоже, на данный момент связаны в основном с поездками и в основном среди вакцинированных людей. Тем не менее, распространение сообщества является уже боялись.
По прогнозам многих стран, случаи заболевания Omicron скоро начнут обгонять случаи заболевания Delta. Главный санитарный врач Онтарио сообщил 12 декабря, что на долю Омикрона приходится 10 процентов всех положительных случаев в провинции, что является подтверждением того, что Омикрон очень передается даже при нынешнем сниженном уровне социальной активности (75 процентов до пандемических уровней.
Чем Омикрон отличается от других вариантов?
Варианты возникают из-за изменений или ошибок, называемых мутациями, в последовательности генома вируса, который представляет собой набор генетических инструкций вируса.
Вариант Omicron имеет значительно больше мутаций, чем другие варианты в его S-гене - гене, кодирующем вирусный белок-шип, который является ключом, обеспечивающим доступ вируса к нашим клеткам. В Omicron накоплено 50 мутаций, в том числе 32 мутации в гене S. Напротив, вариант Alpha имеет девять мутаций в гене S, а вариант Delta - от девяти до 13 мутаций.
Оба варианта более передаемы, чем исходный вариант, на 50% и 100% более трансмиссивны, соответственно, и оба в некоторой степени подвергали сомнению защиту, индуцированную вакциной.
Пока рано говорить, что делать с вариантом Omicron. Поскольку белки состоят из цепочек аминокислот, мутации в гене S приведут к заменам аминокислот, которые вызывают изменения в белке-шипе. Количество аминокислотных замен в белке-шипе Omicron и их совпадение с заменами, наблюдаемыми в других VOC и представляющих интерес вариантах (VOI), делают этот вариант белка-шипа сверхзаряженным.
Спайковый белок Omicron несет шесть уникальных аминокислотных замен , которые не наблюдались в других ЛОС, семь замен, которые наблюдаются в одном или нескольких ЛОС, три замены, которые встречаются во всех текущих ЛОС, а остальные замены наблюдаются в очень значительной степени. меньшая частота в остальных вариантах. Три замены аминокислот, общие для всех ЛОС, связаны с ускользанием от иммунитета, повышенной трансмиссивностью и инфекцией ЛОС.
Является ли Омикрон «супервариантом»?
Как ученый, мне трудно осмыслить этот вариант. Каким образом белок-спайк Omicron накопил 32 аминокислотных замены за очень короткое время и приспособил такое количество замен к одному белку? Стал ли этот белок идеальным ключом для доступа к нашим клеткам и в то же время маскироваться от антител? Омикрон вызывает более серьезные заболевания?
Когда и как появился Омикрон, будет нелегко ответить, но, безусловно, мутации, приобретенные этим вариантом, заставляют ученых ломать голову .
Обращает на себя внимание огромное количество аминокислотных замен в спайковом белке. Белки обладают довольно гибкими способностями приспосабливаться к этим заменам, что позволяет им становиться более эффективными. Но это часто дорого обходится микробу (в данном случае вирусу), потому что замены требуют энергии и ресурсов.
Во-первых, для каждой полезной мутации в гене также должна происходить компенсирующая мутация, чтобы структура белка оставалась неизменной.
Во-вторых, существование такого большого количества мутаций в гене S потребует изменений в реплицирующем механизме вируса, чтобы допустить появление такого количества ошибок. Однако изменение этого механизма может создать проблемы для репликации вируса.
Наконец, вирус полагается на ресурсы хозяина для создания своих белков, таких как специальные молекулы РНК хозяина (передающая РНК) и аминокислоты. Эти и потенциально другие ресурсы могут не соответствовать требованиям вируса и могут привести к его неисправности. То есть мутировавший вирус может столкнуться с проблемой спроса и предложения.
Короче говоря, такой «супермутантный» ген S, скорее всего, повлияет на общую приспособленность вируса; что-то еще должно быть менее эффективным, чтобы обеспечить производство супермутантного S-гена. Такая потеря приспособленности является нормальным явлением для микробного мира. Например, устойчивость бактерий к противомикробным препаратам обусловлена применением антибиотиков. Однако в их отсутствие бактерии часто теряют эту черту, поскольку это требует больших затрат энергии.
Это говорит о том, что вариант Омикрон может быть более передаваемым (как показывают текущие реальные данные), чем Дельта, но он может вызывать менее серьезные заболевания. Эти данные , поступающие из Южной Африки и случаев, выявленных во всем мире свидетельствуют о том , что случаи Omicron не были связаны с тяжелой болезнью и смертью.
Защитят ли вакцины или перенесенная инфекция от Омикрона?
Текущие вакцины были разработаны для защиты от заболевания COVID-19, то есть для защиты от госпитализации и смерти. Однако они показали лучшие результаты, снизив количество инфекций на 80% (для мРНК-вакцин) и ограничив передачу.
Неизвестно, может ли вариант Омикрона избежать иммунитета, вызванного естественной инфекцией или вакциной. Однако исследование, которое еще не прошло рецензирование, показывает, что количество повторных инфекций, вызванных Омикроном, намного выше, чем количество зарегистрированных во время всплесков бета и дельта в Южной Африке.
В этом отчете предполагается, что иммунитет, полученный в результате предыдущих инфекций, вызванных бета- или дельта-вариантами, не может предотвратить заражение Омикроном. Это открытие может объяснить быстрый рост случаев заболевания Омикроном в Южной Африке, где большая часть населения заразилась во время альфа-, бета- и дельта-волн.
В этом исследовании нельзя было сделать никаких выводов о защите индуцированного вакциной иммунитета против Omicron из-за недостаточности данных; уровень вакцинации в Южной Африке составляет всего около 25 процентов. Революционные случаи, связанные с Омикроном, происходящие во всем мире, позволяют предположить, что Омикрон может бросить вызов вакцинам с точки зрения инфекции.
Учтите, что инфекция может протекать бессимптомно или в легкой форме. Вакцины, скорее всего, защитят от тяжелой болезни COVID-19, как показывают недавние отчеты (еще не прошедшие экспертную оценку) из Южной Африки.
В свете многих сообщений о том, что индуцированные вакциной (или естественной инфекции) нейтрализующие антитела со временем ослабевают, многие страны, включая Канаду , спешат ввести бустерные вакцины и увеличить охват вакцинацией, чтобы защитить свое население от возможного возрождения. В клинических исследованиях и реальных данных было показано, что бустерные уколы защищают от инфекции и тяжести заболевания . В недавнем отчете Pfizer указано, что ракета-носитель может изменить траекторию передачи Omicron.
Что ждет Omicron в ближайшем будущем?
Многие лаборатории по всему миру оценивают положение Омикрона в отношении его трансмиссивности, вирулентности, серьезности заболевания, которое он может вызвать, и его способности уклоняться от защиты, индуцированной вакциной. Итак, пока это игра на ожидание.
Здесь, в Канаде, мы должны продолжать увеличивать охват вакцинацией до 90 процентов и выше для подходящего населения. Вакцины работают !
Утверждение вакцин для детей в возрасте от 5 до 11 лет, несомненно, увеличит дальнейший охват вакцинацией и изменит траекторию передачи вируса Омикрон.
В то же время мы должны продолжать принимать меры общественного здравоохранения: маски для лица ( реальные данные показывают, что они предотвращают распространение вируса на 53 процента), физическое расстояние (COVID-19 - болезнь , передающаяся по воздуху ), гигиена рук и недопущение заражения. большие собрания, особенно в помещении.
Наконец, что не менее важно, появление варианта Омикрон еще раз напоминает нам о том, насколько важно помочь развивающимся странам в их кампаниях вакцинации. Вирус будет продолжать бросать вызов прогрессу, достигнутому развитыми странами с помощью вакцинации, до тех пор, пока вирус будет находить благодатную почву для развития в любой точке мира.