Зависит ли тяжесть течения COVID-19 от нашей генетики?
18:30
20.11.2021
Исследователи выявили несколько важных ассоциаций генетических вариантов с генами. Среди них был вариант риска, который затронул 12 из 13 изученных типов клеток.
[caption id="attachment_250677" align="aligncenter" width="1280"] Среди своих выводов исследователи сообщают, что ген в клеточном типе, называемом неклассическими моноцитами, может быть потенциальной мишенью для лечения COVID-19. Фото: Pixabay.com[/caption]
Новое исследование показывает, как генетические вариации, связанные с тяжелыми случаями COVID-19, влияют на наши иммунные клетки.
Исследование, проведенное учеными из Института иммунологии Ла-Хойи (LJI), является одним из первых глубоких исследований связи между серьезностью COVID-19 и экспрессией генов во многих типах иммунных клеток. Эта работа может направить разработку новых методов лечения COVID-19 для усиления функции иммунных клеток, пишет medicalxpress.com.
Среди своих выводов исследователи сообщают, что ген в клеточном типе, называемом неклассическими моноцитами, который является частью команды врожденных иммунных клеток организма, «первой отвечающей», может быть потенциальной мишенью для лечения COVID-19.
«Это исследование подчеркивает способность генетики человека открывать новые пути, связанные с болезнями», - говорит профессор LJI Пандуранган Виджаянанд, доктор медицинских наук, старший автор исследования Nature Communications .
Научное сообщество выявило множество генетических различий , называемых полиморфизмами, которые они называют «вариантами серьезного риска COVID-19». Эти генетические варианты связаны с экспрессией генов и, по-видимому, влияют на тяжесть заболевания. Тем не менее, ученые не знали, какие иммунные клетки больше всего подвержены этим вариантам риска.
Для нового исследования Виджаянанд и его коллеги объединили генетические данные пациентов из Генетической инициативы COVID-19 и базы данных открытого доступа LJI об эпигеномах иммунных клеток (DICE), чтобы определить гены и типы чувствительных клеток, на которые влияют эти варианты риска. Команда исследовала 13 подтипов ключевых защитных и противовирусных клеток организма: Т-клетки, В-клетки, NK-клетки и моноциты.
«Существует много различных типов иммунных клеток, и все они вносят небольшие функции в общую картину», - говорит первый автор исследования Бенджамин Шмидель, доктор философии, инструктор LJI. «Мы должны рассматривать каждый тип иммунных клеток отдельно, чтобы выяснить, как иммунная система способна реагировать на COVID».
Исследователи выявили несколько важных ассоциаций генетических вариантов с генами. Среди них был вариант риска, который затронул 12 из 13 изученных типов клеток. Этот вариант с тяжелым риском COVID-19 в хромосоме 21 был связан со сниженной экспрессией рецептора на клетках, называемого IFNAR2. Этот рецептор является частью сигнального пути, предупреждающего иммунную систему об инфекции. Эта новая ассоциация может помочь объяснить, почему у некоторых людей не возникает сильного иммунного ответа на SARS-CoV-2.
Между тем, вариант риска на хромосоме 12 показал самый сильный эффект на неклассические моноциты, тип врожденной иммунной клетки, которая патрулирует организм и посылает сигнальные молекулы, чтобы предупредить другие иммунные клетки об угрозах. Вариант риска привел к тому, что неклассические моноциты снизили экспрессию гена, называемого OAS1 . Отсутствие экспрессии OAS1 может затруднить защиту организма за счет снижения экспрессии семейства белков, которые обычно разрушают вирусную РНК и активируют противовирусные реакции иммунной системы.
«Неклассические моноциты - это редкий, недостаточно изученный тип клеток», - говорит Шмидель. «Они составляют всего около двух процентов иммунных клеток ».
Шмидель надеется провести дальнейшие доклинические исследования, чтобы определить роль этих генов в патогенезе COVID-19. «То, что мы можем идентифицировать такие генетические механизмы, - большой шаг вперед», - говорит он. «Мы можем использовать имеющуюся информацию, объединить ее с нашими данными об иммунных клетках и найти потенциальные цели для терапии».
Дополнительные авторы исследования «Варианты генетического риска COVID-19 связаны с экспрессией множества генов в различных типах иммунных клеток», в том числе Джоб Роча, Кристиан Гонсалес-Колин, Сурья Бхаттачарья, Ариэль Мадригал, Кристиан Х. Оттенсмайер, Ферхат Эй и Вивек Чандра.