Каждый новый вирус, в геноме которого есть ошибка копирования, отличная от исходного вируса, считается вариантом. Затем, когда эти скопированные вирусы оставляют одного человека заразить другого, они уносят свои изменения с собой.
Возможно, вы недавно видели заголовки об омикронном варианте COVID-19 или читали об этом в социальных сетях. В отношении этого нового варианта все еще существует большая неопределенность, и некоторая информация, которой люди делятся, может вводить в заблуждение. Итак, мы хотим поговорить о варианте омикрона, о том, что мы о нем знаем и чего еще не знаем.Чтобы узнать больше, мы поговорили с двумя исследователями из штата Северная Каролина, которые обладают соответствующими знаниями, пишет medicalxpress.com.Джули Суонн - системный инженер, специализирующаяся в области общественного здравоохранения и проблем, связанных с инфекционными заболеваниями. В 2009 году она работала в Центрах по контролю и профилактике заболеваний в качестве научного консультанта по борьбе с пандемией H1N1. Суонн - руководитель отдела и заслуженный профессор А. Дуга Эллисона кафедры промышленной и системной инженерии Фиттса в штате Северная Каролина. Мэтт Кочи - вирусолог и иммунолог, чья работа сосредоточена на взаимодействии хозяина и микробов у птиц; он - профессор Департамента птицеводства штата Северная Каролина.Резюме: В последнее время в новостях было много дискуссий об омикронном варианте SARS-CoV-2 и о том, что он может означать для пандемии COVID-19. Во-первых, что они имеют в виду, когда говорят о вариантах вируса, вызывающего COVID-19? Что такое «вариант»?Мэтт Кочи: Я знаю. Было сложно угнаться за всеми вариантами.Вирусы, хорошо это или плохо, являются лучшим примером дарвиновской эволюции в реальном времени, и, к сожалению, сейчас все мы занимаем места в первом ряду. У каждого инфицированного человека во всем мире, в каждой инфицированной клетке вирус делает сотни копий самого себя. Копируя свой геном, он иногда допускает небольшие ошибки. Каждая из этих ошибок копирования приводит к тому, что геном немного отличается от оригинала. Вероятно, это происходит десятки раз с каждым инфицированным человеком, если не больше.Геном SARS-CoV-2 составляет около 30 000 нуклеотидов. Написано буквами на странице, которая занимает около восьми страниц. Подумайте только, если бы вам пришлось вручную сделать сотни копий восьмистраничного рассказа. Вы, вероятно, тоже сделаете несколько ошибок при копировании.Каждый новый вирус, в геноме которого есть ошибка копирования, отличная от исходного вируса, считается вариантом. Затем, когда эти скопированные вирусы оставляют одного человека заразить другого, они уносят свои изменения с собой. Этот новый вариант затем становится шаблоном для всех создаваемых новых копий. Некоторые из новых копий будут иметь собственные ошибки, которые добавляются к ошибкам в первом экземпляре. И так далее, и так далее. Вот как мы получаем одни варианты с небольшим количеством изменений, а другие, такие как omicron, - с большим количеством.Ученые всего мира берут некоторые из носовых мазков и слюнных пробирок из всех продолжающихся испытаний и анализируют геномы SARS-CoV-2, чтобы понять, сколько вариантов существует и сколько изменений в каждом варианте. Когда эти варианты впервые идентифицируются, мы не знаем, что они означают. То, что у вируса есть изменение в геноме, не означает, что он будет распространяться быстрее или быть более смертоносным.Вот почему по мере обнаружения новых вариантов по всему миру они добавляются в базу данных. Если новый вариант последовательности имеет изменения, которые, по нашему мнению, могут быть связаны с тем, как иммунная система распознает его или насколько хорошо вакцины и другие методы лечения будут работать против него, он классифицируется как «представляющий интерес вариант». Это означает, что люди начинают обращать на это больше внимания.Если мы видим, что данный интересующий вариант начинает проявляться как все больший и больший процент геномов, обнаруженных в определенной области, или он начинает распространяться за пределы области, в которой он был впервые обнаружен, он становится «вариантом, вызывающим озабоченность». Вот что случилось с омикроном. Растущее число случаев заболевания в Южной Африке и его обнаружение в нескольких других странах на разных континентах привели к тому, что он превратился из варианта, представляющего интерес, в вариант, вызывающий озабоченность.Теперь просто для ясности, и я ненавижу то, что я даже говорю это, но: нет, этот вариант не был запланирован. Я видел несколько человек в социальных сетях, в том числе некоторых политиков и других, которые должны (или знают) лучше, предполагая, что этот вариант был преднамеренным. На этот счет распространяется какая-то заговорщическая чушь. Пожалуйста, если вы видите, что кто-то пытается распространять эту чушь, говоря, что, поскольку «они» знали название варианта до того, как вариант прибыл, значит, все это было запланировано, не оставляйте это без внимания. Это все равно, что сказать, что ураганы преднамеренные, потому что мы знаем, как будет назван следующий ураган.Джули Суонн: Вау, я была далеко от социальных сетей. Я рад, что вы на это указали. Ваше описание вариантов натолкнуло меня на мысль о монахах, копирующих книги при темном освещении. Если монах номер три сделал изменение при копировании, оно повторяется в строке. Чем больше копий вы сделаете, тем больше изменений будет накапливаться.ТА: Насколько я понимаю, мы еще многого не знаем о варианте омикрон. Что мы знаем на данный момент?Koci: Мы знаем, что есть новый вариант проблемы, в геноме которого гораздо больше изменений, чем мы видели в предыдущих вариантах. Многие из этих изменений происходят в местах, которые выглядят так, как будто они могут повлиять на эффективность лечения вакцинами и моноклональными антителами. Мы также знаем, что он появился в странах по всему миру, но это еще рано, и большинство мест только сейчас начинают действительно искать этот вариант. Так что я ожидаю, что список стран с этим вариантом будет расти. [Примечание редактора: через несколько часов после публикации этого вопроса и ответа в США был зарегистрирован первый подтвержденный случай варианта омикрона]Суонн: Я добавлю к этому. Как заметил Мэтт, мы знаем, что этот вариант имеет большое количество мутаций по сравнению с другими штаммами. Первоначальные данные состоят в том, что омикрон имеет около 50 мутаций, из которых 26 мутаций не были в других названных вариантах, и 32 изменения в шиповом белке. Было выпущено изображение, сравнивающее его с дельтой, и похоже, что в нем как минимум вдвое больше мутаций. Мы также знаем, что несколько мутаций омикрона наблюдались в других вариантах, которые были высоко заразными или имели способность избегать предыдущего иммунитета. Некоторые из нас ожидали, что возникнет другой вариант, и что штамм может дать эволюционную пользу, способный прорвать предыдущий иммунитет, по крайней мере частично, что позволит ему распространиться более широко. Возможно, таким вариантом является омикрон.ТА: Какие большие вопросы мы до сих пор не знаем о варианте омикрона? Знаем ли мы, является ли он более заразным или вакцины от COVID-19 обеспечивают защиту от него?Koci: Сейчас мы не знаем ни того, ни другого с большой степенью уверенности. В конце ноября из разных стран поступило несколько сообщений о том, что вариант омикрона более заразен, чем дельта. Эти отчеты не доказывают, что это так, но их было достаточно, чтобы эпидемиологи и вирусологи всего мира сказали: «Нам нужно знать об этом гораздо больше». Я думаю, что в конце концов мы обнаружим, что омикрон более заразен, чем дельта, но чтобы знать, насколько еще нам нужно больше информации.Еще меньше мы знаем о том, насколько хорошо вакцина защитит от этого варианта. Количество мутаций в спайковом белке не является хорошим признаком, и некоторые из них находятся в местах, которые, как показали предыдущие варианты, затрудняют нейтрализацию вируса антителами. Но, опять же, нам нужно больше данных, чтобы знать наверняка. Кроме того, хотя антитела и прекрасны, они составляют лишь половину нашей адаптивной иммунной системы. Скорее всего, наши Т-клетки все еще работают на нас. Это, вероятно, означало бы больше прорывных инфекций, но эти инфекции все равно будут более легкими с меньшим количеством смертей, чем мы увидим у непривитых.Суонн: Вот краткий ответ с моей точки зрения. Мы еще не знаем некоторых вещей. Хотя мы знаем, что есть подтвержденные или вероятные свидетельства этого варианта во многих странах мира, мы не знаем полной степени распространения.Очень вероятно, что это уже есть в Соединенных Штатах, но в скольких местах и насколько широко распространено?Мы считаем, что этот вариант более заразен, чем исходный штамм COVID-19, хотя ученые все еще пытаются определить, насколько сильно.Мы знаем, что этим вирусом инфицированы люди, которые были вакцинированы, хотя все еще ведется работа по оценке степени, в которой он может нарушить существующий иммунитет.Наконец, мы все еще определяем, насколько вероятно, что этот вариант вызовет тяжелое заболевание как у невакцинированного, так и у вакцинированного населения.ТА: Омикрон был впервые обнаружен в Южной Африке, но это не значит, что этот вариант действительно развился там, верно? Вы можете мне это объяснить?Коци: Да. Список стран, которые делают свою работу лучше, чем США, ищут и предупреждают остальной мир о новых вариантах, ошеломляюще длинный. Это также причина, по которой ВОЗ и сообщество инфекционистов в целом настаивали на том, чтобы прекратить называть вирусы после того, как о них впервые было сообщено. В итоге вы получаете вариант вируса, который можно найти практически на всех континентах, но ограничения на поездки применяются только в отношении того места, где вам сообщили об угрозе.Теперь, когда большинство людей в США, ЕС и Великобритании получили вакцины и решили, что нам нужно вернуться к работе, путешествия по миру увеличились. Это означает, что вирусы, подобные SARS-CoV-2, могут перемещаться по земному шару, как если бы это был декабрь 2019 года. Это не аргумент в пользу возврата к глобальной остановке, но мы должны признать, что пандемия еще не закончилась. Когда люди переезжают, мы забираем с собой свои болезни. Мы не можем вечно держать экономику закрытой, но, пытаясь понять, как жить с вирусом, люди должны уметь правильно относиться к аспектам своей жизни, не создавая идеальных условий для мутации и распространения вируса.Суонн: Итог - Южная Африка проводит серьезное тестирование и секвенирование образцов вируса, поэтому неудивительно, что там был обнаружен новый вариант. Первый случай был обнаружен в Ботсване, и мы знаем, что этот штамм подтвержден в ряде других стран. Штамм может перемещаться из одного места в другое с людьми, и это более вероятно в местах с более низким уровнем вакцинации или более высоким уровнем путешествий. Мы должны проявлять осмотрительность и не наказывать Южную Африку за то, что она довела до нашего сведения этот вариант, поскольку он, вероятно, уже во многих местах и, возможно, возник где-то еще.ТА: Как вы думаете, когда мы узнаем больше о варианте омикрона, например, является ли он более заразным?Коци: К концу этой недели мы должны узнать больше о том, насколько хорошо антитела против вакцины действуют против омикрона. [Примечание редактора: эти вопросы и ответы были проведены 1 декабря.] Большинство лабораторий, которые занимались этой работой, уже начали создавать инструменты, которые им нужны, чтобы иметь возможность тестировать что-то еще до того, как в них будет обнаружен настоящий вирус.Что касается того, как долго мы не узнаем наверняка, является ли он более заразным и насколько, это займет немного больше времени. На самом деле, единственный способ узнать это - посмотреть, насколько быстро увеличивается количество случаев омикрона по сравнению с дельта-случаями. Но все страны мира немного отличаются по статусу вакцины, текущему количеству случаев COVID-19, соотношению молодых и старых и так далее. Чтобы понять, что происходит, может потребоваться несколько недель.Суонн: Я считаю, что у меня достаточно данных, чтобы думать, что этот вариант более заразен, чем исходный штамм. Как заявляет мой коллега, степень этого зависит от местных характеристик, таких как предыдущий иммунитет, уровень вакцинации, социальное дистанцирование и т.д. заболевание может быть у вакцинированных или невакцинированных популяций.Если мы дождемся ответов на все, прежде чем принимать решения, будет слишком поздно. Мы должны действовать сейчас. Конечно, это включает в себя приоритетность вакцинации взрослых и детей, а также ревакцинации. Буквально на этой неделе CDC рекомендовал всем 18 лет и старше получить бустер, который может помочь обеспечить защиту от омикрона, даже если эта защита не идеальна. Нам также следует расширить тестирование среди населения, например, для всех, кто собирался вместе с людьми, не являющимися членами их семьи, без масок, и проводить больше тестов в праздничные сезоны. Несмотря на то, что я вакцинирован, я буду носить маски на всех собраниях с не членами семьи (профессиональными или личными). Нашим правительственным агентствам также необходимо провести секвенирование образцов, чтобы понять существующее распространение этого варианта.и мы должны отслеживать случаи по вакцинации. Своевременные действия спасут жизни и уменьшат вероятность перегрузки наших больничных систем. В долгосрочной перспективе нам необходимо продолжать инвестировать в инфраструктуру для борьбы с инфекционными заболеваниями и другими проблемами общественного здравоохранения.
Добавьте новости «Весь Искитим» в избранное ⭐ – и Google будет показывать их выше остальных.