Что мы сегодня знаем об «Омикроне»? Рассказывает эксперт

«Мы прогнозируем, что новый вариант может хуже контролироваться вакцинами, которые у нас есть в настоящее время. Однако пока неясно, насколько новый вариант может повлиять на наши вакцины».

Что такое новый вариант, чем он отличается и насколько мы должны быть обеспокоены?

Новый вариант COVID-19 получил широкое освещение в СМИ из-за опасений, что он может быть более заразным и сделать вакцины менее эффективными. Он содержит необычно большое количество мутаций, особенно в шиповом белке - части вируса, на которую нацелено большинство вакцин, пишет medicalxpress.com.

Вариант, известный как B.1.1.529 или вариант Omicron, был обнаружен в Южной Африке, Гонконге и Израиле и побудил правительство Великобритании добавить шесть стран Африки в свой красный список путешествий.

Последовательность B.1.1.529 была впервые исследована командами, работающими в Ботсване и Гонконге, до того, как ученые из Южной Африки выразили обеспокоенность в связи с резким ростом числа случаев COVID в некоторых регионах страны. Имперские исследователи - один из партнеров южноафриканских экспертов, изучающих этот вариант.

Эксперты из Имперского колледжа Лондона - профессор Нил Фергюсон из директора Центра глобального анализа инфекционных заболеваний Imperial MRC, профессор Венди Барклай, глава департамента инфекционных заболеваний Imperial и доктор Том Пикок из Департамента инфекционных заболеваний - поделились своим анализом. последнее развитие пандемии.

В: Что мы знаем на данный момент?

Ответ: (Нил Фергюсон): Вариант B.1.1.529 имеет беспрецедентное количество мутаций в гене белка Spike, белка, который является мишенью для большинства вакцин. Поэтому существует опасение, что этот вариант может иметь больший потенциал избежать предшествующего иммунитета, чем предыдущие варианты. Также вызывает беспокойство то, что этот вариант, по-видимому, приводит к быстрому увеличению числа случаев заболевания в Южной Африке. Таким образом, решение правительства Великобритании ограничить поездки в Южную Африку является разумным. Однако у нас еще нет надежных оценок того, в какой степени B.1.1.529 может быть более передаточным или более устойчивым к вакцинам, поэтому еще слишком рано давать основанную на доказательствах оценку риска, который он представляет. . Устранение этого разрыва - главный приоритет исследователей в Южной Африке и их партнеров по всему миру, в том числе в Имперском колледже.

В: Почему эти мутации особенно важны, на какие части вируса они влияют и что они могут сделать с вирусом?

О: (Том Пикок): За последние месяцы мы получили много знаний о молекулярной вирусологии SARS-CoV-2 и о возможных последствиях различных мутаций, обнаруженных в предыдущих мутациях. Это означает, что мы можем посмотреть на совокупность мутаций в последовательности генома нового варианта и сделать обоснованные прогнозы относительно их воздействия.

Большая часть того, что мы знаем, относится к спайковому белку вируса - мишени для вакцин и моноклональных антител, которые можно использовать для лечения людей, инфицированных этим вирусом. В белке Spike варианта B.1.1.529 / Omicron больше мутаций, чем в любом другом варианте, который мы видели до сих пор. Точно так же эти мутации находятся в положениях белка, которые вызывают у нас беспокойство, потому что похоже, что они могут поставить под угрозу то, насколько хорошо антитела, которые мы вырабатываем после инфекции или вакцинации, могут бороться с вирусом.

Когда наша иммунная система реагирует на вакцину , они вырабатывают антитела, которые нацелены на различные функции белка-шипа и не позволяют вирусу проникать в наши клетки, тем самым защищая нас от инфекций и болезней. У всех нас развивается так называемый поликлональный ответ - это означает, что мы создаем коктейль из антител к нескольким различным частям спайка. Это хорошо для нас, потому что, если у вируса развивается одна мутация, которая отбрасывает одну подгруппу антител к одной части спайка, у нас обычно есть другие антитела, которые все еще работают, чтобы защитить нас. Другими словами, в системе есть лишняя емкость.

Причина, по которой нас беспокоит новый вариант, заключается в том, что он, по-видимому, имеет мутации во всех идентифицированных антигенных сайтах, как в рецепторсвязывающем домене на вершине шипа, так и в N-концевом домене на стороне шипа. Мы предполагаем, что это может повлиять на распознавание спайкового белка подавляющим большинством антител, даже при поликлональном ответе. Когда у человека меньше антител или когда эти антитела менее способны связываться со спайком, мы знаем, что эффективность вакцины снижается. Итак, мы прогнозируем, что новый вариант может хуже контролироваться вакцинами, которые у нас есть в настоящее время. Однако пока неясно, насколько новый вариант может повлиять на наши вакцины.

Иногда множество изменений, таких как это, сопряжено с определенными потерями для вируса - они могут произойти у одного человека, но не распространяются дальше этого, потому что они ставят под угрозу потенциал передачи вируса. Однако мы также можем видеть два важных изменения в другой области белка-шипа (называемого сайтом расщепления фурином), и мы полагаем, что эти типы изменений связаны с повышенной трансмиссивностью - например, вариант Delta имеет очень сильную мутацию в этой области. Кроме того, другая мутация в новом варианте (изменение остатка 501 на тирозин) связана с лучшим связыванием белка-шипа на вирусных частицах с рецепторами ACE2 наших клеток и способствует усилению передачи альфа-варианта.

Есть также изменения в варианте Omicron, помимо белка-шипа , в других генах вируса, таких как нуклеопротеин, которые недавно были связаны с повышенной приспособленностью SARS CoV-2 в клетках человека. Это связано с тем, что они, возможно, заставляют вирус лучше собирать и упаковывать свой геном внутри своих частиц и, возможно, позволяют вирусу более эффективно противодействовать нашему врожденному иммунному ответу (известному как интерферон).

В: Насколько нам следует волноваться?

О: (Венди Барклай): Взяв вместе все изменения, которые мы можем увидеть в последовательности, и принимая во внимание отчеты об эпидемиологии вируса на данный момент в Южной Африке, где вирус, похоже, быстро перерастает вариант Дельта, и число случаев заболевания растет. сообщается о цифрах - кажется возможным, что у нас есть вариант, который может быть пригодным, передаваться и имеет потенциал, по крайней мере, частично избежать иммунитета, вызванного вакцинами, которые мы в настоящее время используем, и предыдущей инфекцией. Однако мы еще не знаем наверняка, повысил ли вариант Омикрон трансмиссивность или снизит эффективность вакцины. Нам необходимо анализировать эпидемиологические данные по мере их появления (как это было сделано для вариантов Alpha и Delta).

Во-вторых, нам необходимо измерить, насколько хорошо этот вирус реплицируется в модельных системах в лаборатории, и, что наиболее важно, измерить способность антител (от людей, которые были вакцинированы или ранее инфицированы) нейтрализовать новый вариант по сравнению с предыдущими вариантами, такими как Alpha, Бета или Дельта. Мы много знаем о том, насколько эффективны наши вакцины против них. Лаборатории по всему миру готовятся сделать это, в том числе те, которые занимаются консорциумом от генома к феномену здесь, в Великобритании.

В: Что делать, если вакцины не действуют против нового варианта?

Ответ: (Венди Барклай): Если антитела от наших нынешних вакцин уже не так хороши для нейтрализации вируса, у политиков есть варианты.

Во-первых, продолжать призывать как можно больше людей получить вакцины, которые у нас есть, включая бустерные дозы, если они соответствуют критериям. Это связано с тем, что, несмотря на то, что они не полностью согласованы, мы знаем, что простое увеличение общего количества антител (например, после второй и третьей бустерных доз) может в некоторой степени компенсировать любое несоответствие между вакциной и вирусом. Кроме того, вакцины, которые мы используем сейчас, определенно эффективны против варианта Дельта, и все, что мы можем сделать сейчас, чтобы уменьшить текущее количество случаев заболевания, поможет. Мы действительно не хотим, чтобы Delta и Omicron циркулировали в одно и то же время в течение предстоящей зимы, когда на NHS уже оказывается большое давление.

Во-вторых, чтобы уменьшить количество заболевших, мы все можем практиковать лучшее социальное дистанцирование, носить маски в людных местах и ​​проявлять некоторую сдержанность в преддверии праздников.

В-третьих, мы можем начать создавать новые вакцины, которые лучше подходят для нового вируса. Это займет время, скорее всего, месяцы, но производители вакцин должны немедленно подготовиться к этому.

Мы пытаемся выиграть время, замедляя импорт этого нового варианта в Великобританию и по всему миру. Вирус уже был обнаружен в Гонконге и Израиле путешественников , возвращающихся из Южной Африки, так что это будет лишь вопрос времени, прежде чем он прибыл в Великобританию, мы должны тщательно использовать это время.